В 1802 году Владимирский губернатор Иван Михайлович Долгоруков посетил место, где, по его словам, «сильный Петр учился мореплаванью и оставил городу в залог самим же им состроенный первый ботик в государстве нашем». Выполняя указ Петра, он принимает твердое решение построить здание для хранения бота.

1 августа 1803 года первый провинциальный музей России открывает свои двери. На его фронтоне золотом высечено: «Великому Петру усердный Переславль».

В 1842 году возводится каменная сторожка - караульное помещение для отставных матросов, охранявших музей. Спустя 5 лет, в 1847 году, владимирское дворянство выкупило Веськовское поместье в общественную собственность.

Великими князьями Николаем и Михаилом Романовыми 17 августа 1850 года был заложен монумент в память о прибывании Петра I на берегах Плещеева озера. Ровно через два года в присутствии Владимирского губернатора и архиерея состоялось торжественное открытие обелиска.

Строится Ротонда – здание для общественных приемов и танцев. Возводится триумфальная арка.

С сооружением в 1853 году «Белого дворца» усадьба «Ботик Петра I» приобретает окончательный архитектурный облик, сохранившийся до наших дней.

В 1913 году музей усадьбу посетил Николай II. К его приезду были выстроены бельведер и пристань на берегу озера, напротив холма Гремяч.

С 1919 года музей- усадьба “Ботик” становится филиалом Переславского музея. В 1984 году были открыты новые экспозиции.